Les évènements de Touhou Bougetsuhou - Silent Sinner in Blue, littéralement "Vignette de lune éphémère - Criminel silencieux vêtu de bleu" débutent à Gensokyo, l'univers fantasy dans lequel se déroulent la majorité des épisodes de la saga Touhou.Reimu et Marisa décident, avec l'aide des habitants du Manoir du Démon Écarlate, de construire une fusée afin de se rendre sur la Lune. Ce sera l'occasion d'en apprendre plus sur la Capitale Lunaire ainsi que sur le peuple Sélénite. Deux nouveaux personnages seront également introduits : les sœurs Watatsuki.